根據近年來國內外農業生物技術領域的發展趨勢，結合自身的基礎和特色，圍繞云南特有農業生物資源的生物技術研究與應用，形成上、中、下游銜接配套的三大學科方向。

實驗室主要研究方向

? 作物種質資源

特色資源優異基因發掘利用研究；

特色農作物資源基因組學研究；

優質、抗病分子機理研究。

? 作物生物技術育種

開展主要農作物及生物質能源作物的抗病、抗逆和品質改良基因工程育種；

完善細胞工程育種及應用技術體系。

? 應用植物病毒

云南植物病毒基因庫的建立及其應用；

植物病毒地理生態種群進化機制；

重大植物病毒病的發生流行監測與防控；

應用“植物——病毒”復合體模型篩選新型天然抗病毒活性物質。